设计阶段预防：在设计变压器时，将用电负荷平均分配到三相电源，防止一相用电量过大或过小。加强无功补偿，促进三相负荷就地平衡。实时监控运行中的变压器，发现三相不平衡及时处理。

运行监控：定期进行三相不平衡电流测试，特别是在负荷变化较大时，增加测量次数，以掌握配电设计时三相不平衡度的科学计算方法。加强运行中的监视与检查，密切注意电动机的温度、电流、转速的变化，发现故障及时排除。

技术改进：分散不对称负荷，避免单一设备或区域集中使用大量电能。合理设计和改造电网，优化三相负荷的分布和管理。

设备保护：使用时间继电器、交流接触器和电感组成的保护系统，以防止因缺相导致的设备损坏。检查变压器端子是否有接触不良和烧毁缺相的情况，确保所有连接都良好。

通过以上措施，可以有效预防和应对三相变压器缺相运行带来的危害，保障电力系统的安全和稳定。