在轨道交通和谐波治理中，三相变单相变压器的作用主要是通过将三相电压转换为单相电压，以此来实现对电能质量的改善。三相变单相变压器的原理基于电磁感应和法拉第电磁感应定律，通过调整绕组的匝数比例，可以实现从一个电压级别向另一个电压级别的变换。这种变压器能够将三相电压转换为单相电压，并且还具有其他一些应用。

在轨道交通供电系统中，谐波问题是一个重要的挑战，因为谐波量的增大会影响地铁设备系统运行安全。有源滤波器被证明可以有效地治理谐波，将谐波对供电系统的损害降低，从而保障轨道交通的供电可靠性。然而，三相变单相变压器在处理谐波方面的直接效果并未在我搜索到的资料中明确提及。不过，考虑到其基本功能，即转换电压，可以推测其在特定情况下可能通过改变电压水平或调整电流分布间接影响谐波的控制。

尽管如此，需要注意的是，三相功率平衡是使用三相变单相变压器的一个关键因素。如果三相功率不平衡，可能会导致效率降低。因此，在轨道交通和谐波治理中，虽然三相变单相变压器可以作为一种技术手段，但其效果可能受到多种因素的影响，包括但不限于三相功率的平衡状态、变压器的具体配置以及整个供电系统的设计和运行方式。

三相变单相变压器在轨道交通和谐波治理中的作用和效果可能较为间接，其主要通过转换电压来影响电能质量，而非直接消除谐波。